במכון פועלת מרפאה למחלות כליה ויתר לחץ דם המיועדת לחולים בגירים הסובלים ממחלות כליה ולחולים בעלי יתר לחץ דם. המטופלים עוברים תהליכי אבחון הכוללים בדיקה גופנית, ובעת הצורך גם ביופסיות של הכליה. המרפאה מייעצת לרופאי המשפחה באבחון וטיפול בחולים. המרפאה אינה עוסקת בנפרולוגיה פדיאטרית.
מרפאה שנייה הפועלת במכון היא מרפאה לאי-ספיקת כליות, המיועדת לחולי כליות הסובלים ממחלה מתקדמת ועלולים להגיע לשלב סופני וטיפול כלייתי חלופי, כולל דיאליזה או השתלת כליה.
במכון לנפרולוגיה ויתר לחץ דם ניתן טיפול חלופי באי-ספיקת כליות סופנית על ידי כליה מלאכותית - הימודיאליזה, דיאליזה צפקית ביתית כרונית, והכנה להשתלת כליה.
במכון פועלת מרפאת אקסס לדיאליזה בשילוב עם כירורגיה וסקולרית ורדיולוגיה פולשנית, המשרתת מטופלי דיאליזה ומטופלי מרפאה טרום-דיאליטית במסגרת הכנה לטיפול כלייתי חלופי.
המכון לנפרולוגיה ויתר לחץ דם מייעץ למחלקות האשפוז של המרכז הרפואי במקרים של מחלת כליה חדה, יתר לחץ דם, בעיות אלקטרוליטיות ומאזן חומצי-בסיסי ורעלת הריון, כולל, ביצוע טיפולי דיאליזה דחופים. כמו כן, ניתנים ייעוצים לחולי הדיאליזה הכרוניים המאושפזים בבית החולים.
המכון מוכר על ידי המועצה המדעית של ההסתדרות הרפואית בישראל לצורך מתן התמחות מלאה בנפרולוגיה.